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次世代シークエンサーDRY解析教本 (細胞工学別冊) 単行本 – 2015/10/15

5つ星のうち 3.8 7件のカスタマーレビュー

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商品の説明

内容紹介

【商品概要】
遺伝子のデータ解析を始めたいすべての人、バイオインフォマティシャンを育成されている教員の方向け。
プログラミングの知識がなくてもMacが1台あれば今日から始めることができます!
【商品紹介】
本書はこれまで一度もコマンドを叩いたことがない方でも独学で次世代シークエンシング(NGS)のデータ解析が
一定のレベルまでできるようになる入門書です。
Macが1台あれば基本的な解析が行えるようカリキュラムを考え、
執筆陣が各自異なる環境で何度もコマンド実行の検証を重ねています。
各データ解析に必要なマシンスペック(主にメモリ)に合わせたMac購入術から始まり、
データ解析のプロの執筆陣がただ解析プロトコルを披露するだけでなく
初心者が再現・検証を行ったログまでもがこの一冊に集約。
独学書としてだけではなくぜひ次世代のバイオインフォマティシャンを育成されている教員の方にも
講義テキストとしてもおすすめ。
【目次】
■Level 1(準備編)
1Macの買い方
2コマンドラインの使い方
3Rの使い方
4データベースの選び方
5データ解析のための統計の基礎
■Level 2(実践編)
1練習用公開データの選び方
2発現解析
【再現・検証】研究者の妻のDRY解析奮闘日記
3疾患ゲノム解析
【再現・検証】疾患ゲノム解析実習レポート 【再現・検証】有償ソフトウェアならここまでできます
4エピゲノム解析(ChIP-seq/FAIRE-seq/ATAC-seq)
【再現・検証】ウェットなPIのChIP-seqことはじめブログ
5エピゲノム解析(WGBS) 光山統泰 268
【再現・検証】ギーク女優のWGBSガチ実況
【再現・検証】担当編集者のつぶやき検証レポート
■Level 3(論文別・作図コマンド解説) ・R+pairs.panels ・R+vioplot ・R+ggplot2+grid ・R+rGADEM
・R+biomaRt+reshape2+ggplot2+grid+entropy・R+KEGGgraph・R+trisomy.R・R+edgeR+hclust
・R+beanplot+boxplot+barplot+IGV・Perl+R+ChromHMM+IGV
・R+python+visMut2sp.R・Velvet+Murasaki+GMV・Perl+gc_contentSkew+Tcl/Tk
・imlib2+distriSNP ・SQLite3+R+Ruby+Univa Grid Engine

出版社からのコメント

「誰でもできるDRY解析の教科書をつくろう! 」を合言葉に執筆陣が日夜試行錯誤と検証を重ねた結果、プログラミングの知識ゼロからでも始められる前代未聞の本ができました。遺伝子データの解析スキルを身につけたい方にぜひ読んでもらいたい独学本です.

商品の説明をすべて表示する

登録情報

  • 単行本: 408ページ
  • 出版社: 学研プラス (2015/10/15)
  • 言語: 日本語
  • ISBN-10: 4780909201
  • ISBN-13: 978-4780909203
  • 発売日: 2015/10/15
  • 梱包サイズ: 23.4 x 18 x 3 cm
  • おすすめ度: 5つ星のうち 3.8 7件のカスタマーレビュー
  • Amazon 売れ筋ランキング: 本 - 134,230位 (本の売れ筋ランキングを見る)
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7件のカスタマーレビュー

5つ星のうち3.8

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2017年6月14日
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2017年4月2日
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2015年12月7日
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2016年3月1日
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2017年11月7日
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2016年2月11日
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2015年12月9日
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