| ディスク：1 |
|---|
| 1. オープニング |
| 2. マサラタウンのテーマ |
| 3. オーキド博士 |
| 4. オーキド研究所 |
| 5. ライバルあらわる |
| 6. トキワへの道~マサラより |
| 7. 戦い(VS野生ポケモン) |
| 8. 勝利(VS野生ポケモン) |
| 9. ニビシティのテーマ |
| 10. ポケモンセンター |
| 11. ポケモン回復 |
| 12. トキワの森 |
| 13. 道案内 |
| 14. トレーナーあらわる(女の子編) |
| 15. 戦い(VSトレーナー) |
| 16. 勝利(VSトレーナー) |
| 17. おつきみ山のどうくつ |
| 18. ハナダへの道~おつきみ山より |
| 19. ハナダシティのテーマ |
| 20. ポケモンジム |
| 21. マサキのもとへ~ハナダより |
| 22. プリンの歌 |
| 23. クチバシティのテーマ |
| 24. サントアンヌ号 |
| 25. シオンへの道~クチバより |
| 26. ポケモンの笛 |
| 27. トレーナーあらわる(男の子編) |
| 28. 戦い(VSジムリーダー) |
| 29. 勝利(VSジムリーダー) |
| 30. サイクリング |
| 31. シオンタウンのテーマ |
| 32. ポケモンタワー |
| 33. タマムシシティのテーマ |
| 34. カジノ |
| 35. トレーナーあらわる(悪いヤツ編) |
| 36. ロケット団アジト |
| 37. シルフカンパニー |
| 38. 海 |
| 39. グレンタウンのテーマ |
| 40. ポケモン屋敷 |
| 41. 進化 |
| 42. 最後の道 |
| 43. ラストバトル(VSライバル) |
| 44. 殿堂入り |
| 45. エンディング 〈ポケモン図鑑(ファイルナンバー1~53)/ポケモンの鳴き声&ナレーション〉 |
| 46. フシギダネ |
| 47. フシギソウ |
| 48. フシギバナ |
| 49. ヒトカゲ |
| 50. リザード |
| 51. リザードン |
| 52. ゼニガメ |
| 53. カメール |
| 54. カメックス |
| 55. キャタピー |
| 56. トランセル |
| 57. バタフリー |
| 58. ビードル |
| 59. コクーン |
| 60. スピアー |
| 61. ポッポ |
| 62. ビジョン |
| 63. ピジョット |
| 64. コラッタ |
| 65. ラッタ |
| 66. オニスズメ |
| 67. オニドリル |
| 68. アーボ |
| 69. アーボック |
| 70. ピカチュウ |
| 71. ライチュウ |
| 72. サンド |
| 73. サンドパン |
| 74. ニドラン♀ |
| 75. ニドリーナ |
| 76. ニドクイン |
| 77. ニドラン♂ |
| 78. ニドリーノ |
| 79. ニドキング |
| 80. ピッピ |
| 81. ピクシー |
| 82. ロコン |
| 83. キュウコン |
| 84. プリン |
| 85. プクリン |
| 86. ズバット |
| 87. ゴルバット |
| 88. ナゾノクサ |
| 89. クサイハナ |
| 90. ラフレシア |
| 91. パラス |
| 92. パラセクト |
| 93. コンパン |
| 94. モルフォン |
| 95. ディグダ |
| 96. ディグダ |
| 97. ニャース |
| 98. ペルシアン |
| ディスク：2 |
| 1. コダック |
| 2. ゴルダック |
| 3. マンキー |
| 4. オコリザル |
| 5. ガーディ |
| 6. ウインディ |
| 7. ニョロモ |
| 8. ニョロゾ |
| 9. ニョロボン |
| 10. ケーシィ |
| 11. ユンゲラー |
| 12. フーディン |
| 13. ワンリキー |
| 14. ゴーリキー |
| 15. カイリキー |
| 16. マダツボミ |
| 17. ウツドン |
| 18. ウツボット |
| 19. メノクラゲ |
| 20. ドククラゲ |
| 21. イシツブテ |
| 22. ゴローン |
| 23. ゴローニャ |
| 24. ポニータ |
| 25. ギャロップ |
| 26. ヤドン |
| 27. ヤドラン |
| 28. コイル |
| 29. レアコイル |
| 30. カモネギ |
| 31. ドードー |
| 32. ドードリオ |
| 33. パウワウ |
| 34. ジュゴン |
| 35. ベトベター |
| 36. ベトベトン |
| 37. シェルダー |
| 38. パルシェン |
| 39. ゴース |
| 40. ゴースト |
| 41. ゲンガー |
| 42. イワーク |
| 43. スリープ |
| 44. スリーパー |
| 45. クラブ |
| 46. キングラー |
| 47. ビリリダマ |
| 48. マルマイン |
| 49. タマタマ |
| 50. ナッシー |
| 51. カラカラ |
| 52. ガラガラ |
| 53. サワムラー |
| 54. エビワラー |
| 55. ベロリンガ |
| 56. ドガース |
| 57. マタドガス |
| 58. サイホーン |
| 59. サイドン |
| 60. ラッキー |
| 61. モンジャラ |
| 62. ガルーラ |
| 63. タッツー |
| 64. シードラ |
| 65. トサキント |
| 66. アズマオウ |
| 67. ヒトデマン |
| 68. スターミー |
| 69. バリヤード |
| 70. ストライク |
| 71. ルージュラ |
| 72. エレブー |
| 73. ブーバー |
| 74. カイロス |
| 75. ケンタロス |
| 76. コイキング |
| 77. ギャラドス |
| 78. ラプラス |
| 79. メタモン |
| 80. イーブイ |
| 81. シャワーズ |
| 82. サンダース |
| 83. ブースター |
| 84. ポリゴン |
| 85. オムナイト |
| 86. オムスター |
| 87. カブト |
| 88. カブトプス |
| 89. プテラ |
| 90. カビゴン |
| 91. フリーザー |
| 92. サンダー |
| 93. ファイヤー |
| 94. ミニリュウ |
| 95. ハクリュー |
| 96. カイリュー |
| 97. ミュウツー |
| 98. ミュウ |
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